Dankzij de moderne technologie en dosimetrische onderzoeken via computer zijn neveneffecten van de straling in gezonde weefsels een stuk minder. Ze zijn evenwel nog niet volledig verdwenen. 

De voornaamste neveneffecten verschillen naargelang de plaats van inplanting.

• In de buik: diarree, cystitis (blaasontsteking), anitis (anusontsteking), braakneigingen, buikpijn.
• In de borstkas: dysfagie (moeilijkheden en pijn bij het slikken), hoest.
• In de mond: smaakverlies, verminderde speekselproductie, irritatie van de slijmvliezen.
• De huid: rode vlekken, jeuk, verkleuring.
• In de geslachtsorganen: risico op onvruchtbaarheid (kan blijvend zijn).

Haarverlies doet zich niet voor, behalve bij bestraling van de hoofdhuid.

Deze neveneffecten zijn van voorbijgaande aard en verdwijnen meestal enkele weken na de behandeling. Hun intensiteit en duur verschillen van persoon tot persoon.